El INIDETAM depende directamente de la Dirección General De Investigación y Desarrollo y su estructura orgánica está integrada en total por:
01 Dirección General
05 Direcciones de Área
13 Subdirecciones
24 Puestos de Investigadores de áreas
11 Departamentos
04 Laboratorios
Entre el personal que integra la planilla orgánica del Instituto, se cuenta con especialista en las siguientes áreas de conocimiento